La nueva estación de Cadaqués se sitúa a la entrada del municipio, en la riera de Sant Vicenç, y dispone de un acceso desde la carretera de Port Lligat. Ocupa una superficie rectangular de unos 3.000 metros cuadrados, que alberga un edificio terminal y un área cubierta con una gran marquesina.
La estación dispone de cuatro andenes para las paradas de los autobuses además de una zona para el estacionamiento de vehículos de transporte colectivo de pasajeros. La parte de andenes ocupa 485 metros cuadrados y se complementa con el edificio de la terminal de 75 metros cuadrados, que acoge la sala de espera, las áreas para la venta de billetes, servicios y otras dependencias.
La nueva estación dispone de un sistema de información a los viajeros, controlado por un servidor central ubicado en la oficina del jefe de estación. El sistema enviará los datos a dos pantallas, una situada en la terminal, en la sala de espera, y otra en la zona de andenes. La estación también dispone de sistemas de megafonía y video vigilancia. La construcción de la nueva estación de autobuses de Cadaqués se ha completado con la mejora de los accesos.